近年来，由于养殖业的快速发展使得养殖污染成为农业污染的主要来源，养殖场污水的处理成为畜禽养殖业健康、可持续发展的主要因素。但是，研究表明，我国畜禽养殖规模仍在继续增加，养殖总量每年仍旧不断增长，对环境造成的危害越来越大。规模化养殖场所产生的污水主要是一些高悬浮物、高浓度、高氨氮、处理难度较大的废水。相对集中、数量大、处理难度大的特点导致畜禽养殖废水在处理过程中存在许多问题。

1、相对集中：受到人工管理模式的影响，冲洗栏舍的时间基本统一在早上或者晚上，这样相对集中的时间会导致污水的产生也相对集中。另外由于农业生产是季节性的，大量集中的粪便和污水量使得周围的农田无法全部消纳，对环境造成了严重的危害。

2、数量大：由于畜禽养殖业的快速发展，带来了许多的养殖专业户和专业养殖场。其次是由于大部分猪场是漏板式的栏舍且采用水冲式清粪，这就导致了排水量很大。

3、处理难度大：由于废水固液混杂，浊度高，有机质浓度较高，且富含氮、磷等物质，极易产生腐败。大量的粪便污水相对集中，难以运输，无法在周围有限的土地上完全消化而成为重要的污染源，严重污染了周边环境。其次，污水中抗生素和重金属的残留问题也逐渐成为养殖场污水处理的重点；另外由于受自然和市场的双重影响，有风险，废水处理费用高，人们往往在污水处理上资金投入少。