由于面向养殖企业的基层农技推广部门技术力量相对薄弱,人员力量欠缺,存在推广难度大、技术落地难的问题,对技术成果的推广应用会产生一定的制约效果。

农业污水是造成地下水污染最普遍的因素,也是最难治理的污染源之一,由于其形成过程随机性大、潜伏周期长以及影响因素复杂等,因此相应的研究和污染控制难度也较大。但养殖粪肥对地下水的污染比化肥污水都要高出8%,养殖粪水和沼液直接还田对地下水的污染风险也显著高于化肥,有关养殖对地下水污染风险的评价及控制的研究需要深入开展。

粪污从收集、处理到后期利用的过程中,不仅会导致大量的养分流失,还会造成大气、水体和土壤的污染,其中以氨气或氮气形式挥发的氮流失占一半比例,但目前对这方面的研究还不多,尤其是粪便长周期堆肥过程中产生的臭气和成本控制以及厌氧工程中沼气贮存和有效利用是亟待解决的技术难点。在资源化利用方面,沼液如何按农时运输并灌溉,长期使用养殖粪肥造成的重金属和抗生素残留问题等也是亟待解决的技术难点。以抗生素为例,畜禽养殖业用于促进动物生长及疾病预防和治疗的抗生素用量超过一定量时,其中有一半左右的抗生素会残留在动物的粪污中,这对发展生态农业、有机农业造成了极大的不便,也影响着粪污资源化利用的推进。