水专项根据流域特点,以种养结合为理念研发了多项畜禽养殖污染治理的适用技术,其中既有集成的移动式生态养殖、山地果园种养结合养殖、原位发酵床养猪等技术,也有针对技术难点攻克的适用技术,包括种养结合、源头节水、粪便堆肥、厌氧发酵、沼液利用、尾水净化、粪污资源化利用、沼液能源化利用等技术和设备。如山地果畜结合区面源污染控制技术针对东江源头区的地貌特征,以小流域为系统单元,山集成了滞留塘生态净化系统构建、有机固体废物循环利用、生猪养殖高氨氮废水处理等技术,从系统结构上实现养殖废物的循环利用,实现“控源、减排、净化”的污染防治目标。应用该技术已在脐橙果园进行示范推广,通过生态化改造,在山沟养殖生猪,有效保护了果园生态环境,并辐射带动周边农户致富。该技术在安远县的脐橙果园逐步推广应用,推动了该区域农业循环经济,促进了果业和畜禽养殖业的发展,对水资源保护起到积极作用。

从“十一五”至今,通过水专项的研究,共发布12项与养殖污染控制相关的技术规范或指南。国家层面发布的包括《畜禽养殖业污染治理工程技术规范》、《畜禽养殖污染发酵床治理工程技术指南(2014)》等,省市层面的包括《江苏省污水生物净化处理技术规程》、《等,内容涵盖了养殖场建设、区域规划、污染控制、资源化利用等多个环节,也有针对发酵床养殖污染防治、污水生态净化、雨污分流、粪便集中收集等具体技术的规范和指南。